1、自然发酵：将鸡粪发酵成有机肥的最常用的方式是自然发酵。具体来说，就是将鸡粪平铺在一个有太阳直射的地方，将它们给晒干。然后将它们堆积在一起，并在顶部盖一层塑料膜，以起到保温的作用。这样，鸡粪就可以自然升温、发酵。等鸡粪内部的气温上升到70℃左右时，要撤掉塑料膜，并且将它们平摊开降温。等温度降到50℃左右的时候重复堆积覆膜的过程。这样反复2-3次，鸡粪就会发酵变成有机肥了。
2、烘干发酵：除了利用太阳曝晒就进行自然发酵的方式以外，鸡粪还可以用烘干的方式进行发酵。具体来说，就是先利用加热的方式将鸡粪烘干。然后将它们平铺好，并且往其中加入千分之五的发酵剂稀释液和草粉混合物，再将它们堆积起来，并用稻草覆盖保温。等内部温度升到60℃左右时，撤去稻草。翻动一次鸡粪，添加少量的发酵剂并再次覆盖稻草。等温度再次上升至60℃左右，基本上就发酵完成了。