进口货运代理最需要注意的是货物的所有权问题，货物所有人在跟进口代理商谈妥之后，必须签订进口代理协议，规定货物的所有权，以避免由此产生的纠纷。而进口代理商也要适时维护自己的权益，由于放货给客户之后而没有得到应得利益而产生的纠纷以及法律诉讼案例，已不胜枚举。
按照报关的对象，可分为运输工具报关，货物报关和物品报关。进出境运输工具(包括用以载运人员，货物，物品进出境，在国际间运营的各种境内或境外航空器，船舶，车辆和驮畜等)作为人员，货物，物品的进出境载体，其报关主要是向海关数据直接交验随附的，符合国际商业运输惯例，能反映运输工具进出境合法性及其所承运货物，物品情况的合法证件，清单和其他运输单证，报关手续较为简单。进出境物品(主要包括进出境的行李物品，邮递物品和其他物品)由于它的非贸易性质，且一般限于自用，合理数量，报关手续也很简单。进出境货物(主要包括一般进出口货物，保税货物，特定减免税货物，暂准进出口货物以及过境，转运和通运货物等)的报关手续较为复杂，海关数据根据对不同类型进出境货物的监管要求，制定了一系列报关管理规范，并且要求必须由具备一定专业知识和技能且经过海关数据核准的专业人员代表报关单位专门办理。
专家指出，在进行危险品货运代理时，相关代理人员需格外注意，尤其是在运输过程中要更为谨慎。危险品在装运前应根据其性质、运送路程、沿途路况等采用安全的方式包装好。包装必须牢固、严密，在包装上做好清晰、规范、易识别的标志。装运危险品必须选用合适的车辆，爆炸品、一级氧化剂、有机氧化物不得用全挂汽车列车、三轮机动车、摩托车、人力三轮车和自行车装运;爆炸器、一级氧化剂、有机过氧物、一级易燃品不得用拖拉机装运。除二级固定危险品外，其它危险品不得用自卸汽车装运。危货运输忌火，危险品在装卸时应使用不产生火花的工具，车厢内严禁吸烟，车辆不得靠近明火、高温场所和太阳暴晒的地方。装运石油类的油罐车在停驶、装卸时应安装好地线，行驶时，应使地线触地，以防静电产生火灾。

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